Skip to Main Content
Table III

Quantification of focal collections of mkatG and Mtb 16S rRNA DNA in sarcoidosis and control tissues







mkatG
 forward probe

Mtb 16S rRNA
 forward probe

H. pylori 16S rRNA
 forward probe
Group
Sample
Tissue
Pathologya
Fields viewedb
Focal
 collectionsc
Interpretationd
Focal
 collectionsc
Interpretationd
Focal
 collectionsc
Interpretationd
Mtb pleura CAS + NC 32   − 
 lung CAS + NC 14 − − 
 liver CAS + NC 32  >30 10 − 
 lung CAS + NC 32  >30 10 − 
Control lung diff-GC 40 − − − 
Wegener
 granulomatosis lung diff-GC 24 − − − 
 lung diff-GC 40 − − − 
 lung diff-GC 32 − − − 
 lung diff-GC 28 −     
Control lung 36 − − − 
UIP lung Int + F 24 − − − 
 lung 24 − − − 
 lung 24 −   − 
Control lung none 24 − − − 
No pathology lung none 24 − − − 
 lung none 20 − − − 
 lung none 20 − − − 
 LN none 36 − − − 
 LN none 24 − − − 
 LN none 24 − − − 
 LN none 24 − − − 
 LN none 20 − − − 
Sarcoidosis lung NC 48 12 − 
 lung NC + F 20 26 − 
 lung NC + F 32 − indeterminate − 
 lung NC 20 − − − 
 lung NC 40 − indeterminate − 
 lung NC 40 indeterminate − − 
 lung NC + F 20 indeterminate indeterminate − 
 lung NC 20 −     
 lung NC 20 − − − 
 10 lung NC 20 indeterminate − 
 11 lung NC 28 − 
 12 LN NC 32   − 
 13 LN NC 28 − 
 14 LN NC 28 indeterminate   
 15 LN NC 36 − indeterminate − 
 16 LN NC 28 − 
 17 LN NC 16 − − − 

 
18
 
LN
 
NC
 
16
 
0
 

 
1
 
indeterminate
 
0
 

 






mkatG
 forward probe

Mtb 16S rRNA
 forward probe

H. pylori 16S rRNA
 forward probe
Group
Sample
Tissue
Pathologya
Fields viewedb
Focal
 collectionsc
Interpretationd
Focal
 collectionsc
Interpretationd
Focal
 collectionsc
Interpretationd
Mtb pleura CAS + NC 32   − 
 lung CAS + NC 14 − − 
 liver CAS + NC 32  >30 10 − 
 lung CAS + NC 32  >30 10 − 
Control lung diff-GC 40 − − − 
Wegener
 granulomatosis lung diff-GC 24 − − − 
 lung diff-GC 40 − − − 
 lung diff-GC 32 − − − 
 lung diff-GC 28 −     
Control lung 36 − − − 
UIP lung Int + F 24 − − − 
 lung 24 − − − 
 lung 24 −   − 
Control lung none 24 − − − 
No pathology lung none 24 − − − 
 lung none 20 − − − 
 lung none 20 − − − 
 LN none 36 − − − 
 LN none 24 − − − 
 LN none 24 − − − 
 LN none 24 − − − 
 LN none 20 − − − 
Sarcoidosis lung NC 48 12 − 
 lung NC + F 20 26 − 
 lung NC + F 32 − indeterminate − 
 lung NC 20 − − − 
 lung NC 40 − indeterminate − 
 lung NC 40 indeterminate − − 
 lung NC + F 20 indeterminate indeterminate − 
 lung NC 20 −     
 lung NC 20 − − − 
 10 lung NC 20 indeterminate − 
 11 lung NC 28 − 
 12 LN NC 32   − 
 13 LN NC 28 − 
 14 LN NC 28 indeterminate   
 15 LN NC 36 − indeterminate − 
 16 LN NC 28 − 
 17 LN NC 16 − − − 

 
18
 
LN
 
NC
 
16
 
0
 

 
1
 
indeterminate
 
0
 

 
a

CAS, caseous granulomatous inflammation; NC, noncaseating granulomatous inflammation; diff-GC, diffuse granulomatous inflammation with giant cells; Int, cellular interstitial infiltrate; F, fibrosis.

b

Number of high power fields (400×) viewed for analysis.

c

Number of focal collections of ISH staining (positive signal).

d

Negative, <0.5 focal collections per 10 high power fields examined; indeterminate, 0.5–1.0 focal collections per 10 high power fields examined; positive, >1.0 focal collections per 10 high power fields examined.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal