Skip to Main Content
Table 3.

Similarity analyses of TRBV6-1+, TRBV6-2/3+, TRBV20-1+, and TRBV28+ CDR3 sequences

Group 1 Group 2 Similarity 
(A) Similarity analyses across individuals  
D497 D497 0.858 
D497 D518 0.840 
D497 D520 0.838 
D497 D674 0.852 
D518 D497 0.852 
D518 D518 0.859 
D518 D520 0.838 
D518 D674 0.849 
D520 D497 0.841 
D520 D518 0.830 
D520 D520 0.850 
D520 D674 0.837 
D674 D497 0.849 
D674 D518 0.837 
D674 D520 0.833 
D674 D674 0.858 
(B) Similarity analyses across pathogens  
C. albicans C. albicans 0.861 
C. albicans S. typhimurium 0.855 
C. albicans M. smegmatis 0.842 
C. albicans TRAV1-2+ TNF 0.853 
S. typhimurium C. albicans 0.842 
S. typhimurium S. typhimurium 0.855 
S. typhimurium M. smegmatis 0.838 
S. typhimurium TRAV1-2+ TNF 0.847 
M. smegmatis C. albicans 0.843 
M. smegmatis S. typhimurium 0.853 
M. smegmatis M. smegmatis 0.869 
M. smegmatis TRAV1-2+ TNF 0.848 
(C) Similarity analyses across nonreactive (TNF) and pathogen-reactive (TNF+) subsets 
TRAV1-2+ TNF M. smegmatis 0.844 
TRAV1-2+ TNF S. typhimurium 0.857 
TRAV1-2+ TNF C. albicans 0.845 
TRAV1-2+ TNF TRAV1-2+ TNF 0.858 
Group 1 Group 2 Similarity 
(A) Similarity analyses across individuals  
D497 D497 0.858 
D497 D518 0.840 
D497 D520 0.838 
D497 D674 0.852 
D518 D497 0.852 
D518 D518 0.859 
D518 D520 0.838 
D518 D674 0.849 
D520 D497 0.841 
D520 D518 0.830 
D520 D520 0.850 
D520 D674 0.837 
D674 D497 0.849 
D674 D518 0.837 
D674 D520 0.833 
D674 D674 0.858 
(B) Similarity analyses across pathogens  
C. albicans C. albicans 0.861 
C. albicans S. typhimurium 0.855 
C. albicans M. smegmatis 0.842 
C. albicans TRAV1-2+ TNF 0.853 
S. typhimurium C. albicans 0.842 
S. typhimurium S. typhimurium 0.855 
S. typhimurium M. smegmatis 0.838 
S. typhimurium TRAV1-2+ TNF 0.847 
M. smegmatis C. albicans 0.843 
M. smegmatis S. typhimurium 0.853 
M. smegmatis M. smegmatis 0.869 
M. smegmatis TRAV1-2+ TNF 0.848 
(C) Similarity analyses across nonreactive (TNF) and pathogen-reactive (TNF+) subsets 
TRAV1-2+ TNF M. smegmatis 0.844 
TRAV1-2+ TNF S. typhimurium 0.857 
TRAV1-2+ TNF C. albicans 0.845 
TRAV1-2+ TNF TRAV1-2+ TNF 0.858 

Bolded values denote those with the highest similarity within each comparison group.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal